Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WW87

IGKV2-40, Immunoglobulin kappa variable 2-40, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV2-40A0A087WW87 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
IGKV2-40A0A087WW87 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
IGKV2-40A0A087WW87 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms