Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PIAS3Q9Y6X2 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PIAS3Q9Y6X2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms