Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD54BQ9Y620 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms