Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C3Q9Y5Q9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms