Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UTP11Q9Y3A2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
UTP11Q9Y3A2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms