Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
KDM2AQ9Y2K7 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms