Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DTX4Q9Y2E6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DTX4Q9Y2E6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms