Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SHOC2Q9UQ13 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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