Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SETD1BQ9UPS6 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SETD1BQ9UPS6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms