Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GGA1Q9UJY5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GGA1Q9UJY5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms