Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SCN11AQ9UI33 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCN11AQ9UI33 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms