Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPS1Q9UHF7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms