Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM5

FETUB, Fetuin-B, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FETUBQ9UGM5 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
FETUBQ9UGM5 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
FETUBQ9UGM5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms