Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CFDP1Q9UEE9 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFDP1Q9UEE9 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms