Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
DKK4Q9UBT3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DKK4Q9UBT3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms