Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHPF2Q9P2E5 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms