Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KCMF1Q9P0J7 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KCMF1Q9P0J7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms