Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RDH8Q9NYR8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RDH8Q9NYR8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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RDH8Q9NYR8 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RDH8Q9NYR8 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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