Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CACNA2D2Q9NY47 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms