Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
KLHL28Q9NXS3 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms