Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FANCLQ9NW38 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms