Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.05
UFSP2Q9NUQ7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
UFSP2Q9NUQ7 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms