Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GINM1Q9NU53 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms