Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
EMILIN3Q9NT22 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms