Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

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Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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LTBP3Q9NS15 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LTBP3Q9NS15 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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