Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
VPS45Q9NRW7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms