Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NRIP3Q9NQ35 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms