Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
A4GALTQ9NPC4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms