Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms