Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GSDMCQ9BYG8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms