Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
MAP1LC3CQ9BXW4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.2 ms