Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SALL3Q9BXA9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SALL3Q9BXA9 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms