Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
NDFIP1Q9BT67 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms