Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
RHOXF2Q9BQY4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RHOXF2Q9BQY4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms