Protein–RNA interactions for Protein: Q99795

GPA33, Cell surface A33 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPA33Q99795 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GPA33Q99795 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms