Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CHP1Q99653 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms