Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TCF12Q99081 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TCF12Q99081 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms