Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY7

IFT140, Intraflagellar transport protein 140 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT140Q96RY7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IFT140Q96RY7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IFT140Q96RY7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms