Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC4A9Q96Q91 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC4A9Q96Q91 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 201 ms