Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CCDC85AQ96PX6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC85AQ96PX6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms