Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NLRP3Q96P20 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NLRP3Q96P20 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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