Protein–RNA interactions for Protein: Q96N53

LINC00167, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00167, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00167Q96N53 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00167Q96N53 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms