Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NSMCE2Q96MF7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NSMCE2Q96MF7 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms