Protein–RNA interactions for Protein: Q96MD7

C9orf85, Uncharacterized protein C9orf85, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf85Q96MD7 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
C9orf85Q96MD7 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms