Protein–RNA interactions for Protein: Q96M60

FAM227B, Protein FAM227B, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227BQ96M60 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
FAM227BQ96M60 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms