Protein–RNA interactions for Protein: Q96LS8

C2orf48, Uncharacterized protein C2orf48, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf48Q96LS8 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
C2orf48Q96LS8 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms