Protein–RNA interactions for Protein: Q96L46

CAPNS2, Calpain small subunit 2, humanhuman

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS2Q96L46 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPNS2Q96L46 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
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