Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
USP47Q96K76 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
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USP47Q96K76 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
USP47Q96K76 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
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