Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHAMP1Q96JM3 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHAMP1Q96JM3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms