Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CDK5RAP3Q96JB5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms